Durch Verwendung von Präparaten, die Saccharomyces boulardii oder Saccharomyces cerevisiae enthalten, sind in seltenen Fällen Fungämien aufgetreten, die bei schwer kranken Patienten zu Todesfällen führen können.
Deshalb dürfen solche Präparate schwer kranken oder immunsupprimierten Patienten bzw. Patienten mit einem zentralen Venenkatheter nicht mehr gegeben werden. Auch andere Menschen, die sich in der Nähe schwer kranker Menschen aufhalten oder in der Umgebung von mit Saccharomyces boulardii behandelten Patienten sind, haben ebenso das Risiko, damit kontaminiert zu werden und die Mikroorganismen zu übertragen. Deshalb dürfen auch die Kapseln nicht in entsprechenden Krankenzimmern geöffnet oder berührt werden oder außerhalb berührt werden und dann entsprechende Kranke berührt werden ohne sich vorher die Hände zu desinfizieren.
Saccharomyces boulardii ist ein Ersatz für die Darmflora, die aus einer Hefekultur stammt und sehr nützlich bei Durchfallerkrankungen, jedoch eben nicht bei der oben genannten Patientengruppe.
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